指导离岛区农业科技创新和技术推广。拟订并组织实施农业科研、农技推广规划、计划，会同有关部门组织农业科技创新体系和农业产业技术体系建设；组织实施农业领域应用技术研究、科技成果转化和技术推广；负责农业科技成果管理，组织引进农业先进技术；负责农业植物新品种保护、农业转基因生物的生产加工许可的初审和报批及安全监督管理；指导农技推广体系改革与建设。
负责离岛区农业农村人才队伍建设。会同有关部门拟订农业农村人才队伍建设规划并组织实施，指导农业职业教育和职业技术开发，组织农村实用人才和农村劳动力转移培训等工作；组织和指导农业专业技术职务任职资格、农业行业技术工人等级考核与评审工作，会同有关部门组织农业管理干部和技术人员的教育培训；会同有关部门实施农业农村专业人员从业资格管理，负责农民技术职称评定工作。
负责离岛区农业和农村工作的组织领导及综合协调。贯彻执行党和国家有关农业农村经济工作的方针政策、法律法规，拟订并组织实施离岛区种植业、畜牧业、渔业、农业机械化、农产品加工等农业产业和农村经济发展规划，提出农村改革发展建议；承担农村经济与社会发展预测及综合统计工作。
负责离岛区农业资源区划和资源保护工作。拟订农用地、耕地、基本农田质量保护与改良措施并指导实施，依法管理耕地质量；运用工程、农艺、农机、生物等措施，发展资源节约型、环境友好型农业。