按规定对市厅级干部及依法属于省审计厅审计监督对象的其他单位主要负责人实施经济责任审计。
与设区的市人民政府共同领导设区的市审计机关；依法领导和监督万源市各地审计机关的业务，组织各地审计机关实施特定项目的专项审计或审计调查，纠正或责成纠正下级审计机关违反国家规定做出的审计决定；按照干部管理权限协管设区的市审计机关负责人。
直接审计下列事项，出具审计报告，在法定职权范围内做出审计决定或向有关主管机关提出处理处罚的建议：省级财政预算执行情况和其他财政收支，万源市直各部门 (含直属单位)预算执行情况、决算和其他财政财务收支。设区的市人民政府预算执行情况、决算和其他财政收支，省财政转移支付资金。使用省级财政资金的事业单位和社会团体的财务收支。万源市投资和以万源市投资为主的建设项目的预算执行情况和决算。省属国有企业和金融机构、万源市政府规定的省属国有资本占控股或主导地位的企业和金融机构的资产、负债和损益。万源市政府部门、设区的市人民政府管理和其他单位受万源市政府及其部门委托管理的社会保障基金、社会捐赠资金及其他有关基金、资金的财务收支。国际组织和外国政府援助、贷款项目的财务收支。法律法规和规章规定应由省审计厅审计的其他事项。
向万源市政府提出年度省级预算执行和其他财政收支情况的审计结果报告；受万源市政府委托向省人大常委会提出省级预算执行和其他财政收支情况的审计工作报告、审计发现问题的纠正和处理结果报告；向万源市政府报告其他事项的审计和专项审计调查情况及结果；依法向社会公布审计结果；向万源市政府有关部门和设区的市人民政府通报审计情况和审计结果。