承担阿拉尔农场耕地保护和节约集约利用土地资源的职责。拟订耕地保护政策，监督占用耕地补偿制度执行情况；负责农村土地开发、整治、复垦工作的指导和管理。负责土地用途管制，承担农用地转用和土地征收征用审核报批管理工作；拟订并实施土地开发利用标准，承担土地分等定级工作；建立并监督执行基准地价、土地出让金标准等地价制度；管理和监督城乡建设用地供应、土地储备、土地开发和节约集约利用；管理和监督农村综合产权的流转交易。
承担阿拉尔农场地质灾害预防和治理的职责。组织、协调、指导和监督地质灾害防治工作；制订并组织实施重大地质灾害等国土资源突发事件应急预案，指导应急处置。
承担依法征收阿拉尔农场资源收益的职责。负责国土资源和房屋管理专项资金、基金征收。负责有关资金、基金的预算和财务、资产管理与监督。承担报县政府审批的改制企业的国有土地资产处置。
承担保护与合理利用阿拉尔农场土地、矿产等自然资源的职责。编制和组织实施国土资源规划，制定并组织实施国土资源节约集约利用政策措施；组织拟订国土资源发展规划，开展国土资源供需总量平衡及经济形势分析，参与区域经济运行、区域协调、城乡统筹的研究并拟订国土资源调控政策措施；推进国土资源科技进步和信息化。