负责玉林重要江河、水库、湖泊及河口的治理和开发，组织实施具有控制性或跨地区的重要水利工程的建设与运行管理，组织实施有关涉河涉堤建设项目审批（含占用水域审批）并监督实施，负责水利工程建设项目和水利建设市场的监督管理。
开展玉林水利科技、教育和队伍建设。组织水利科学研究、技术推广及国际合作交流，拟订水利行业的技术标准、规程规范、定额并监督实施；组织开展水利行业质量监督工作，指导玉林水利队伍和农村基层水利服务体系建设；组织、指导水利信息化工作。
负责水利设施、水域及其岸线的管理与保护。负责玉林水利基建项目建议书、可行性研究报告、初步设计和施工图的审查、审批。
指导玉林水文工作。负责水文水资源监测、水文站网建设和管理，对江河湖库和地下水的水量、水质实施监测，发布水文水资源信息、情报预报。