承担五湖渔场职业病预防控制工作任务，开展有毒有害作业场所卫生监测和控制效果评价、预评价及从业人员健康监护等技术服务工作。
承担五湖渔场传染性疾病、慢性非传染性疾病、寄生虫病、地方病、学生常见病等疾病预防和控制工作任务，对重大疾病流行趋势进行监测与预测预警。
承担五湖渔场健康教育与健康促进工作任务，制订五湖渔场辖区内不同人群的疾病预防控制健康教育、健康促进方案并组织实施，指导县（市）疾控机构开展健康教育与健康促进活动，并做好督导、检查和评估工作。
承担五湖渔场辖区免疫规划工作任务；负责五湖渔场预防性生物制品的使用管理。