会同肃南县有关部门组织科技重大专项实施中的方案论证、综合平衡、评估验收和配套政策制定，对科技重大专项实施中的重大调整提出意见；负责科技重大专项和重大科技产业工程的组织实施。
负责本部门预算中的科技经费预决算及经费使用的监督管理；会同肃南县有关部门提出科技资源合理配置的政策和措施建议，优化科技资源配置。
制定政策引导类科技计划并指导实施；会同有关部门拟订肃南县高新技术企业发展、高新技术产业化的相关政策，参与拟订科技金融促进工作的相关政策；提出科研条件保障规划和政策建议；推进科研条件平台建设和科技资源共享。
制定肃南县科普工作规划和政策；制定促进技术市场、科技中介组织发展的政策措施；负责技术市场、科技保密管理工作和科技奖励组织实施工作；负责科技信息、科技统计和科技期刊管理工作。