协调崇左委、崇左政府各部门的职能配置及其调整；协调崇左委各部门之间、崇左政府各部门之间、崇左委各部门与崇左政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
研究拟定崇左机构编制宏观规划和年度计划，并监督实施；办理市直机关事业单位上下编事宜；协同有关部门做好市直机关事业单位人员调入、录用和政策性分配安置工作。
研究拟定崇左行政管理体制改革与机构改革方案及有关规定；审核市直各部门和区县(市)党政机构改革方案；指导、协调各级行政管理体制改革和机构改革以及机构编制管理工作。
研究拟定崇左事业单位管理体制和机构改革方案，负责事业单位机构编制管理工作；负责市直副处级以上事业单位机构设置(含内设机构)、职能配置、人员编制的审核和科级领导职数的审批；审核市直科级事业单位机构设置、职能配置、人员编制和领导职数；提出市直副处级以上事业单位领导班子职数配备的建议；审核区、县(市)副科级以上事业单位机构设置；制订崇左性事业单位机构编制标准；指导、协调各级各类事业单位管理体制改革和机构编制管理工作。