指导杭锦旗农业产业化发展。促进农业产前、产中、产后一体化发展。拟订并组织实施农产品加工业发展规划，提出农业产业保护政策建议，培育、保护和发展农产品品牌；指导杭锦旗农产品加工业结构调整、技术创新和服务体系建设；制定农业生产资料、主要农产品市场体系建设发展规划。
负责杭锦旗农业农村人才队伍建设。会同有关部门拟订农业农村人才队伍建设规划并组织实施，指导农业职业教育和职业技术开发，组织农村实用人才和农村劳动力转移培训等工作；组织和指导农业专业技术职务任职资格、农业行业技术工人等级考核与评审工作，会同有关部门组织农业管理干部和技术人员的教育培训；会同有关部门实施农业农村专业人员从业资格管理，负责农民技术职称评定工作。
指导杭锦旗农业生产。组织落实促进主要农产品生产发展的相关政策措施，指导农业标准化、规模化生产，引导农业产业结构调整和农产品品质改善；提出杭锦旗农业固定资产投资规模和方向、县级发展农业的财政性资金安排建议；配合有关部门组织实施农业综合开发和基本农田建设项目。
指导杭锦旗农业科技创新和技术推广。拟订并组织实施农业科研、农技推广规划、计划，会同有关部门组织农业科技创新体系和农业产业技术体系建设；组织实施农业领域应用技术研究、科技成果转化和技术推广；负责农业科技成果管理，组织引进农业先进技术；负责农业植物新品种保护、农业转基因生物的生产加工许可的初审和报批及安全监督管理；指导农技推广体系改革与建设。