贯彻执行党中央、国务院确定的对台方针、政策和省台办、阿拉善左旗委、阿拉善左旗政府的对台工作部署，制定并组织实施阿拉善左旗对台工作计划、规划。
负责组织、指导、管理、协调阿拉善左旗对台工作。检查了解阿拉善左旗各县（市）区、各部门贯彻执行党中央、国务院对台方针、政策和省、市对台工作部署的落实情况。协调处理阿拉善左旗涉台重大事件。
负责统筹协调和指导阿拉善左旗对台经济工作，组织或参与重要的对台招商活动，受理台商和台资企业的投诉，协调处理台资企业的矛盾和纠纷。
负责统筹协调和指导阿拉善左旗与台湾的金融、文化、教育、科技、卫生、体育等各个领域的交流与合作以及两岸人员往来、考察、研讨等工作。