负责阿拉善右旗人大、市政协、市中级人民法院、市人民检察院机关和各民主党派、人民团体机关的机构设置(含内设机构)、人员编制的审核和科级领导职数的审批，提出领导班子职数配备的建议。
负责阿拉善右旗委、阿拉善右旗政府各部门的机构设置(含内设机构)、人员编制的审核和科级领导职数的审批，提出阿拉善右旗委、阿拉善右旗政府各部门领导班子职数配备的建议；审核区县(市)党政群机关副科级以上机构设置和县乡党政群机关的行政编制总额。
协调阿拉善右旗委、阿拉善右旗政府各部门的职能配置及其调整；协调阿拉善右旗委各部门之间、阿拉善右旗政府各部门之间、阿拉善右旗委各部门与阿拉善右旗政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
研究拟定阿拉善右旗行政管理体制改革与机构改革方案及有关规定；审核市直各部门和区县(市)党政机构改革方案；指导、协调各级行政管理体制改革和机构改革以及机构编制管理工作。