协调神农架委、神农架政府各部门的职能配置及其调整；协调神农架委各部门之间、神农架政府各部门之间、神农架委各部门与神农架政府各部门之间以及各部门与区县(市)之间的职责分工。
负责神农架机构改革和机构编制管理有关信息的采集和情况综合，负责机构编制统计和培训工作。
研究拟定神农架行政管理体制改革与机构改革方案及有关规定；审核市直各部门和区县(市)党政机构改革方案；指导、协调各级行政管理体制改革和机构改革以及机构编制管理工作。
贯彻执行国家和省有关事业单位登记管理的法律、法规、规章，拟定神农架事业单位登记管理的规范性文件，并组织实施；负责市级登记管辖范围内事业单位的登记、年检年审和监督管理工作；负责事业单位登记管理行政复议、行政诉讼应诉工作，检查监督和指导协调神农架事业单位登记管理工作。