征收关税和其他税、费。关税是对进出境货物、物品所征收的税，征税主体是黑龙江海关，征收关税是海关的基本职能之一。海关可以依法在进出口环节代征税款，以及依法收取费用。
查缉走私。这是黑龙江海关的基本职能之一，也是海关非常重要的职能。走私是逃避海关监管，进行非法的进出境活动，偷逃关税，非法牟取暴利，扰乱破坏社会经济秩序，严重危害国家主权和国家利益的违法犯罪行为。因此，必须坚决打击走私活动，查处走私案件，缉拿走私犯罪人员，惩罚走私行为。
编制黑龙江海关统计表。这又称海关统计，是国家进出口货物贸易统计，由海关负责。
监管黑龙江进出境的运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品。这里所指的进出境运输工具，是指用以载运人员、货物、物品进出境的各种船舶、车辆、航空器和驮畜。货物是指贸易性的，而物品则是非贸易性的，它们在进出境时是海关监管的对象。